Recomendação do Editor | |
1. O conteúdo é excelente e inovador. A pesquisa sistemática sobre os tipos, quantidade, estrutura e outros aspectos dos microrganismos do leito de fermentação apresentados neste livro não foi relatada antes. É o primeiro trabalho de pesquisa a explicar as mudanças e efeitos do microbioma no processo de fermentação de poluentes orgânicos. 2. A estrutura é razoável. Este livro resume o desenvolvimento de leitos de fermentação ectópicos, apresenta os métodos de pesquisa metagenômica de comunidades microbianas do leito de fermentação, revela os tipos de bactérias e fungos em leitos de fermentação e explica sistematicamente a diversidade do microbioma do leito de fermentação ectópico. 3. O conteúdo é detalhado e confiável. O autor deste livro é profissional e experiente. |
Índice | |
Visão geral do capítulo / 1 Seção Progresso da pesquisa em leitos de fermentação microbiana 1 1. Origem da tecnologia de criação de suínos em leitos de fermentação microbiana 1 2. Princípios da tecnologia de criação de suínos em leitos de fermentação microbiana 2 3. Gerenciamento de leitos de fermentação microbiana 2 4. Pesquisa sobre características microbianas de leitos de fermentação 3 5. Tecnologia de utilização de recursos de colchões de leitos de fermentação microbiana 6 Seção 2 Progresso da pesquisa em análise de microbioma com base na tecnologia de metagenômica 7 1. Desenvolvimento e aplicação da tecnologia de metagenômica microbiana 7 2. Progresso da pesquisa em metagenômica de comunidade bacteriana 10 3. Progresso da pesquisa em metagenômica de comunidade fúngica 21 Seção 3 Princípio e estrutura de leitos de fermentação ex-situ 32 1. Princípio e processo de tratamento de leitos de fermentação ex-situ 32 2. Projeto estrutural de leitos de fermentação microbiana ex-situ 33 3. Operação e gerenciamento de leitos de fermentação microbiana ex situ 35 4. Discussão 36 Capítulo 2 Métodos de pesquisa sobre metagenômica de microrganismos de leitos de fermentação / 39 Visão geral da seção 39 1. Princípio e vantagens dos leitos de fermentação 39 2. Progresso da pesquisa sobre comunidades microbianas em leitos de fermentação 39 3. Pesquisa sobre análise de microbioma com base na tecnologia de metagenômica 40 Seção 2 Métodos de pesquisa sobre análise de microbioma de colchões de leito de fermentação com base na tecnologia de metagenômica 40 1. Coleta de amostra de colchão de leito de fermentação e determinação de propriedades fitoquímicas de colchões Colchões 40 2. Classificação do grau de fermentação de materiais de colchão de fermentação 41 3. Sequenciamento metagenômico de alto rendimento 41 4. Controle de qualidade de dados de sequenciamento metagenômico 41 5. Análise de cluster de unidades operacionais de classificação (OTUs) 41 6. Nivelamento de unidades operacionais de classificação (OTUs) 41 7. Análise do microbioma central 41 8. Classificação de espécies e análise de abundância 42 9. Análise da complexidade da amostra 42 10. Análise de diferença significativa 42 Seção 3 Sequenciamento de alto rendimento e fluxo de trabalho estatístico de microrganismos do leito de fermentação 43 1. Sequenciamento de alto rendimento do microbioma 43 2. Remoção de sequência curta 44 Seção 4 Análise de unidades operacionais de classificação bacteriana (OTUs) de leitos de fermentação microbiana 45 1. Extração de unidades operacionais de classificação bacteriana (OTUs) de leitos de fermentação 45 2. Comparação de unidades operacionais de classificação bacteriana (OTUs) de leitos de fermentação 45 3. Nivelamento de unidades operacionais de classificação bacteriana (OTUs) de leitos de fermentação 46 4. Curva de diluição de unidades operacionais de classificação bacteriana (OTUs) de leitos de fermentação 46 5. α-diversidade de unidades operacionais de classificação bacteriana (OTUs) de leitos de fermentação 48 VI. Evolução da filogenia de espécies de microrganismos (OTUs) em algumas amostras de leitos de fermentação 49 Seção V. Análise de grupos microbianos centrais (OUTs) em leitos de fermentação microbiana 50 1. Relação entre o número de OTUs comuns e o número de amostras cobertas no microbioma do leito de fermentação 50 2. Análise de grupos microbianos comuns e únicos (OTUs) no inverno e na primavera em leitos de fermentação microbiana 50 3. Análise de componentes principais da abundância de grupos microbianos (OTUs) em leitos de fermentação 51 4. Curva de abundância de classificação de grupos microbianos (OTUs) em leitos de fermentação 51 5. Curva cumulativa de espécies em grupos microbianos (OTUs) em leitos de fermentação 52 VI. Distribuição do número de unidades taxonômicas em grupos microbianos (OTUs) em leitos de fermentação 53 VII. Análise de histograma da abundância de grupos microbianos (OTUs) em leitos de fermentação 53 VIII. Análise de histograma da abundância de grupos microbianos (OTUs) em leitos de fermentação no inverno e na primavera 54 IX. Análise de mapa de calor da abundância de espécies em grupos microbianos (OTUs) em leitos de fermentação 54 X. Análise de mapa estelar da abundância de espécies em grupos microbianos (OTUs) em leitos de fermentação 54 Seção 6 Análise da complexidade de espécies de diversidade α do microbioma do leito de fermentação (OTUs) 56 1. Análise da complexidade de espécies do microbioma (OTUs) de uma única amostra no leito de fermentação 56 2. Análise de gráfico de caixa do microbioma (OTUs) no inverno e na primavera no leito de fermentação 56 3. Teste de soma de postos do índice de diversidade α do microbioma (OTUs) no leito de fermentação 56 Seção 7 Análise da complexidade de espécies de diversidade β do microbioma (OTUs) no leito de fermentação 58 1. Distância UniFrac do microbioma (OTUs) entre amostras do leito de fermentação 58 2. Análise de cluster da distância UniFrac do microbioma (OTUs) entre amostras do leito de fermentação 58 3. Análise de componentes principais (PCA) do microbioma (OTUs) entre amostras de leito de fermentação 58 Seção 8 Análise de diferença do microbioma (OTUs) no leito de fermentação 59 1. Análise discriminante de efeito diferencial (LEfSe) do microbioma (OTUs) no leito de fermentação 59 2. Análise de diferença do microbioma (OTUs) de diferentes níveis taxonômicos no leito de fermentação 60 3. Análise das diferenças no microbioma (OTUs) do nível de classificação do gênero do leito de fermentação 60 4. Mapa de calor e análise de componentes principais do microbioma (OTUs) do leito de fermentação no inverno e na primavera 61 Seção 9 Análise de redundância de espécies (RDA) do microbioma (OTUs) do leito de fermentação 61 1. Análise de gradiente 61 2. Resultados da análise 62 Seção 10 Discussão 62 1. Controle da poluição agrícola de fontes difusas de esterco de gado e aves em meu país 62 2. A metagenômica microbiana tem sido amplamente utilizada em pesquisa em ecologia microbiana 63 3. Análise metagenômica de metagenomas microbianos em leitos de fermentação de suínos 63 4. Análise da complexidade de espécies de diversidade α do microbioma (OTUs) do leito de fermentação 63 Capítulo 3 Análise metagenômica de microrganismos em leitos de fermentação ex situ / 65 Seção Coleta de amostras e análise de dados 65 1. Coleta de amostras 65 2. Determinação metagenômica 66 3. Análise de dados 67 Seção 2 Análise do índice de diversidade de espécies do microbioma (OTUs) 73 1. Índice de diversidade de espécies bacterianas (OTUs) 73 2. Índice de diversidade de espécies fúngicas (OTUs) 74 Seção 3 Análise das curvas de diluição de espécies do microbioma 75 1. Análise da curva de diluição de espécies bacterianas (OTUs) 75 2. Análise da curva de diluição de espécies fúngicas (OTUs) 75 Seção 4 Estrutura da razão de abundância de espécies de grupos microbianos (OTUs) 77 1. Estrutura da razão de abundância de espécies bacterianas (OTUs) 77 2. Estrutura da razão de abundância de espécies fúngicas (OTUs) 80 Seção 5 Análise de componentes de espécies de grupos microbianos (OTUs) 83 1. Análise de componentes principais (PCA) de espécies microbianas 83 2. Análise de coordenadas principais (PCoA) de espécies microbianas 107 3. Análise de escala multidimensional não métrica (NMDS) com base na distância de diversidade Beta 108 Seção 6 Estrutura de abundância de bactérias em leitos de fermentação heterotópicos 109 Seção 7 Análise do diagrama de Venn de espécies de grupos microbianos (OTUs) 113 1. Coleta de dados do diagrama de Venn de espécies bacterianas 113 2. Coleta de dados do diagrama de Venn de espécies fúngicas 152 Capítulo 4 Diversidade do microbioma bacteriano em leitos de fermentação heterotópicos / 159 Seção Diversidade da distribuição do número (leituras) da comunidade bacteriana 159 1. Estrutura de distribuição do número do filo bacteriano (leituras) 159 2. Estrutura de distribuição do número de classe bacteriana (leituras) 162 3. Estrutura de distribuição do número de ordem bacteriana (leituras) 165 4. Estrutura de distribuição do número de família bacteriana (leituras) 170 5. Estrutura de distribuição do número de gênero bacteriano (leituras) 178 6. Estrutura de distribuição do número de espécies bacterianas (leituras) 192 Seção 2 Diversidade de distribuição de tipos de comunidade bacteriana (OTUs) 193 1. Estrutura de distribuição de tipos de filo bacteriano (OTUs) 193 2. Estrutura de distribuição de tipos de classe bacteriana (OTUs) 194 3. Estrutura de distribuição de tipos de ordem bacteriana (OTUs) 199 4. Estrutura de distribuição de tipos de família bacteriana (OTUs) 202 5. Estrutura de distribuição de tipos de gênero bacteriano (OTUs) 209 6. Estrutura de distribuição de tipos de espécies bacterianas (OTUs) 223 Seção 3 Diversidade de distribuição da abundância bacteriana (%) 224 1. Estrutura de distribuição da abundância do filo bacteriano (%) 224 2. Estrutura de distribuição da abundância da classe bacteriana (%) 229 3. Estrutura de distribuição da abundância (%) das ordens bacterianas 236 4. Estrutura de distribuição da abundância (%) das famílias bacterianas 242 5. Estrutura de distribuição da abundância (%) dos gêneros bacterianos 252 6. Estrutura de distribuição da abundância (%) das espécies bacterianas 270 Capítulo 5 Diversidade do microbioma fúngico em leitos de fermentação heterotópicos / 278 Seção Diversidade da distribuição do número (leituras) da comunidade fúngica 278 1. Estrutura de distribuição do número (leituras) dos filos fúngicos 278 2. Estrutura de distribuição do número (leituras) das classes fúngicas 283 3. Estrutura de distribuição do número (leituras) das ordens fúngicas 294 4. Estrutura de distribuição do número (leituras) das famílias fúngicas 307 5. Estrutura de distribuição do número (leituras) dos gêneros fúngicos 325 6. Estrutura de distribuição do número (leituras) das espécies fúngicas 345 Seção 2 Diversidade da distribuição de espécies da comunidade fúngica (OTUs) 365 1. Estrutura de distribuição de Eukaryota (OTUs) 365 2. Estrutura de distribuição de espécies (OTUs) de filos fúngicos 366 3. Estrutura de distribuição de espécies (OTUs) de classes fúngicas 367 4. Estrutura de distribuição de espécies (OTUs) de ordens fúngicas 368 5. Estrutura de distribuição de espécies (OTUs) de famílias fúngicas 370 6. Estrutura de distribuição de espécies (OTUs) de gêneros fúngicos 372 7. Estrutura de distribuição de espécies (OTUs) de fungos 374 Referências / 378 Apêndice / 385 1. Esboço da classificação fúngica 385 1. Mastozoomicetos 385 2. Zigomicetos 385 3. Ascomicetos 386 4. Basidiomicetos 387 5. Deuteromicetos 388 6. Análise terminológica 389 2. Esboço da classificação bacteriana 390 1. Elementos de classificação bacteriana 390 2. Alguns nomes bacterianos 394 |
breve introdução | |
Este livro estuda as mudanças no microbioma durante o tratamento de esterco de porco em um leito de fermentação ex situ. O livro é dividido em 5 capítulos, que explicam respectivamente a visão geral dos leitos de fermentação microbiana, os métodos de pesquisa de metagenômica microbiana em leitos de fermentação, a análise da metagenômica microbiana em leitos de fermentação ex situ, a diversidade do microbioma bacteriano em leitos de fermentação ex situ e a diversidade do microbioma fúngico em leitos de fermentação ex situ. Além disso, o livro fornece um esboço taxonômico para fungos e bactérias. Este livro pode ser usado como referência para pesquisadores científicos, técnicos empresariais e gerentes envolvidos no tratamento microbiano de poluentes orgânicos e sua reciclagem de resíduos e campos relacionados, bem como para professores e alunos de ciências ambientais e engenharia, ecologia e especializações relacionadas em faculdades e universidades. |
Sobre o autor | |
Liu Bo, Diretor do Instituto de Recursos Biológicos Agrícolas, Academia de Ciências Agrícolas de Fujian, pesquisador, professor, recebeu seu Ph.D. da Universidade Agrícola de Fujian em 1987, e foi um pesquisador de pós-doutorado na Universidade de Bonn, Alemanha, de 1992 a 1994. Ele foi um pesquisador visitante na Universidade de Michigan, nos Estados Unidos, de 1994 a 1995, e um pesquisador visitante na Universidade de Bonn, na Alemanha, para pesquisa cooperativa de curto prazo por 1-3 meses a cada ano, de 1996 a 2002. Desde 2002, ele foi contratado como o segundo supervisor de doutorado de pesquisa em patologia vegetal na Universidade de Bonn, na Alemanha, e recrutou 3 alunos de doutorado da Universidade de Bonn, na Alemanha. Ele é atualmente o vice-presidente da Academia de Ciências Agrícolas de Fujian e um pesquisador de segundo nível. Ele também atua como vice-presidente do Comitê Profissional de Aplicação Agrícola de Alta Tecnologia da Sociedade Chinesa de Agronomia, membro do Comitê Permanente da Associação de Ciência e Tecnologia de Fujian, vice-presidente da Sociedade de Agronomia de Fujian, diretor executivo da Associação de Especialistas de Fujian, vice-presidente da Sociedade de Bioquímica e Biologia Molecular de Fujian, presidente da Sociedade Entomológica de Fujian, membro do conselho editorial da "Ciência Agrícola Chinesa", "Jornal de Ciência Agroambiental", "Controle Biológico Chinês", "Jornal de Ciências Agrárias de Fujian", etc., segundo supervisor de doutorado do Instituto de Patologia Vegetal da Universidade de Bonn, Alemanha, segundo supervisor de doutorado do Instituto de Biotecnologia da Universidade de Zhejiang, supervisor de pós-graduação da Universidade Agrícola e Florestal de Fujian e especialista chinês na Equipe de Inovação em Microbiologia da Academia de Ciências Agrárias de Fujian e no Projeto de Pesquisa de Cooperação em Biocontrole Sino-Alemão. |
Críticas da mídia | |
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